J'ai lu sur le site du ministère de l'économie que l'entreprise peut appliquer (théoriquement à la demande du salarié) un taux "neutre" reposant sur le montant du salaire versé, une possibilité est que cette clause soit mise par défaut dans les contrats par les employeurs en l'absence de mesure spécifique.
http://www.economie.gouv.fr/vous-orienter/particulier/impots/impot-2016-revenus-2015/prelevement-a-la-source-en-10-questions